Все палеогеографические, климатические и растительные перемены имели важные последствия для животных. Менее специализированные виды в основном выжили, и ино-гда, когда появлялись новые экологические ниши, они породили много потомков, (в основном птиц и зверей). Высоко специализированные виды в основном не пережили коллапс экосистем Мезозоя. Эффект на рептилиях, которые до этого были главными среди позвоночных, был ужасным. Всё, что осталось от главных 20 или около групп рептилий Мезозоя, это черепахи, крокодилы, ящерицы, (включая варанов), и змеи. Амфибии, которые уже представляли только небольшую часть фауны Мезозоя, испытали такую же судьбу. От Третичной эры вперёд, нам встречаются только саламандры, тритоны и лягушки (Palaeobatrachus grandipes), из которых последние являются самыми многочисленными амфибиями. Некоторые из них были прямыми предками современных лягушек, тогда как среди саламандр третичный Andrias scheuchzeri стал хорошо известным.